Himeko Kurusugawa dan Chikane Himemiya adalah dua gadis sekolah menengah di Akademi Ototachibana yang bergengsi di desa fiksi Jepang Mahoroba. Mereka juga merupakan reinkarnasi dari miko matahari dan bulan. Ketika musuh kuno mereka, Orochi (Yamata no Orochi berkepala delapan dari cerita rakyat Jepang) bangkit sekali lagi, persona gadis-gadis yang telah lama disegel itu bangkit untuk mempertahankan dunia! Manga Spin-off 'Kannazuki no Miko' dan reinkarnasi ke-4 dari Himeko dan Chikane. Kannazuki No Miko - reinkarnasi alternatif ke-1 Kyoushiro To Towa No Sora - reinkarnasi alternatif ke-2 Zettai Shoujo Seiiki Amnesian - reinkarnasi alternatif ke-3
