Kisah Lucky Star menggambarkan kehidupan beberapa siswi sekolah menengah Jepang dengan nada humor yang sangat longgar.
Latarnya didasarkan pada kota Kasukabe di Prefektur Saitama. Tokoh utama wanitanya adalah Konata Izumi, seorang gadis atletis dan cerdas yang, meskipun memiliki sifat-sifat tersebut, tidak tergabung dalam klub olahraga, dan memiliki nilai yang rendah. Kemalasannya di sekolah disebabkan oleh kecintaannya pada anime dan video game serta kurangnya minat pada hal lain. Dengan kata lain: dia seorang otaku.
Serialisasi ini dimulai dengan empat karakter utama di tahun pertama sekolah menengah mereka: Konata Izumi, Kagami Hiiragi, Tsukasa Hiiragi, dan Miyuki Takara. Seiring berjalannya cerita, mereka pindah ke tahun kedua dan ketiga.