Oreki Houtarou adalah tipe pria "penghemat energi", yang mengeluarkan energi sesedikit mungkin untuk melakukan hanya hal-hal yang harus dia lakukan. Ketika dia mulai sekolah menengah, kakak perempuannya mengiriminya surat yang memintanya untuk bergabung dengan Klub Klasik. Klub itu sangat berarti baginya, dan jumlah anggotanya telah dikurangi menjadi nol. Houtarou dengan enggan mendaftar ke klub, hanya untuk mengetahui bahwa orang lain juga telah bergabung! Dia adalah Chitanda Eru, seorang gadis imut bermata besar dengan rasa ingin tahu yang luar biasa. Sebuah misteri muncul yang menarik minat Eru, dan juga menarik teman Houtarou, Fukube Satoshi. Mereka terus memecahkan misteri duniawi bersama-sama, dan segera mereka melibatkan Satoshi dan teman Houtarou, Ibara Mayaka, juga. Mayaka sangat menyukai Satoshi sejak sekolah menengah, tapi dia selalu menangkis rayuannya. Bersama-sama, mereka mencari kebenaran dalam misteri yang melibatkan sejarah Classics Club.