Ceritanya terjadi di dunia fiksi yang penuh dengan monster dan petualang yang disebut Pemburu Monster, yang, seperti namanya, memburu monster-monster ini. Plot berputar di sekitar Monster Hunter muda, Shiki, yang dibawa sebagai magang ke Monster Hunter bernama Gurelli sebagai seorang anak. Beberapa tahun setelah kematian Gurelli, yang disebabkan oleh insiden bubuk mesiu, dia kembali ke kediaman tuannya, Kota Akamaaya, untuk bergabung dengan guild di sana. Di guild itu, dia bertemu dengan seorang gadis bernama Irie dan setelah serangkaian kejadian, dia menemukan bahwa dia adalah putri dari tuannya. Sejak saat itu, mereka membentuk sebuah kelompok untuk menemukan Miogaruna yang legendaris, yang merupakan ambisi seumur hidup Gurelli.
