Berdasarkan kisah nyata yang diposting di 2ch, Molester Man adalah kisah tentang bagaimana Molester Man disalahartikan sebagai penguntit oleh Miss Understanding, dan bagaimana mereka mengatasi tantangan pribadi mereka sambil perlahan-lahan semakin dekat satu sama lain. "Molester Man" dan "Miss Understanding" hanyalah nama samaran (nama palsu untuk menyembunyikan nama asli) yang digunakan oleh penulis manga.
