Hanya ada satu Magi Craft Meister di dunia. Setelah kematian Meister terakhir lebih dari seribu tahun yang lalu, Jin Nidou dipindahkan ke dunia lain untuk menggantikan keinginannya. Setelah mendapatkan pengetahuan tentang Magi Craft Meister, Jin mencoba menggunakan gerbang warp tetapi tidak berfungsi, memindahkannya ke dunia yang tidak dikenal. Bersamaan dengan itu, sebuah automata yang baru-baru ini dia pulihkan juga menggunakan warp gate untuk mencari “ayahnya”. Dengan demikian, perjalanan pembuatan Magi Craft Meister yang baru dimulai!
